Отдел микробиологических исследований

Отдел микробиологических исследований (ОМИ) является структурным подразделением ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Республике Татарстан (Татарстан)». Основная функция ОМИ – достоверное выполнение исследований в рамках государственного задания с целью обеспечения надзорной функции Управления Роспотребнадзора по Республике Татарстан; оперативный контроль качества и безопасности продукции, объектов окружающей среды для поддержания санитарно-эпидемиологического благополучия и предупреждение распространения инфекционных заболеваний.

Объектами исследований являются пищевые продукты, продовольственное сырье, материалы, контактирующие с пищевыми продуктами, питьевая вода, дезинфекционные средства, товары детского ассортимента, медицинский инструментарий, перевязочный, шовный материал, аптечные формы (в том числе на стерильность); парфюмерно-косметические изделия и средства гигиены полости рта, объекты окружающей среды, изделия личной гигиены, лечебной грязи и клинического материала от людей. Испытания выполняются на соответствие Санитарным правилам и нормативам и 14 Техническим Регламентам Таможенного Союза, 98,6% методов, включенных в перечень ТР ТС, освоены и используются в деятельности ОМИ.

В составе отдела функционируют три лаборатории и одно отделение: бактериологическая лаборатория (ЛБИ) и паразитологическая лаборатория (ЛПИ), вирусологическая лаборатория (ЛДООиВИ) и отделение диагностики особо опасных инфекций (ОДООИ). В отделе заняты 58 человек, в т.ч. 1 кандидат медицинских наук, 16 врачей и фельдшеров-лаборантов высшей квалификационной категории, 3 технических эксперта Россаккредитации. Специалисты отдела своевременно проходят обучение на базе ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» Роспотребнадзора, ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора, Института медицинской паразитологии им. Е.И. Марциновского, Первого медицинского университета им. И.М.Сеченова и т.д.

В 2018 году в связи с вводом в эксплуатацию нового лабораторного корпуса в помещениях отдела созданы все необходимые условия для эксплуатации имеющегося и приобретенного высокотехнологичного оборудования экспертного класса, способного в короткие сроки и по доступной цене обеспечить выполнение исследований на наличие возбудителей инфекционных заболеваний, по показателям качества пищевых продуктов, ГМО.

Имеющееся оборудование также позволяет анализировать состояние объектов окружающей среды, выявить эпидемиологическую связь между штаммами, выделенными у лиц, контактных с инфекционными больными, или штаммами, изолированными с объектов окружающей среды, определить наличие устойчивости к антимикробным средствам.

ОМИ получены все разрешительные документы по новому месту осуществления деятельности:

• лицензия на медицинскую деятельность;
• лицензия на работу с возбудителями инфекционных заболеваний II-IV групп патогенности;
• 5 санитарно-эпидемиологических заключений

Для индикации и идентификации возбудителей особо опасных инфекций, в т.ч. I группы патогенности, в ОМИ введены в эксплуатацию новые помещения с автономным блоком для работы с инфицированными животными, оснащенные боксом 3 класса защиты.

Блок для работы с инфицированными животными имеет автономную систему приточно-вытяжной вентиляции с экраном управления (оператором задается влажность и температура воздуха в помещениях, контролируется работа фильтров). Блок оснащен системой газового пожаротушения.

Для содержания биопробных животных, зараженных ПБА, на специальных стеллажах имеются индивидуально вентилируемые клетки, с предварительной подготовкой поступающего воздуха и фильтрацией отработанного воздуха через фильтры HEPA 14. Установки предназначены для поддержания барьера с постоянным отрицательным давлением в клетке и обеспечивают изоляцию находящихся в клетке животных от внешней среды, а также минимизирует поступление патогенных микроорганизмов, передающихся воздушно-капельным путем (биоизоляция).

В бактериологической лаборатории введен в эксплуатацию масс-спектрометр Vitek MS, позволяющий быстро и точно проводить экспресс-диагностику инфекционных заболеваний, классифицировать штаммы из различных изолятов, проводить анализ присутствия широкого спектра микроорганизмов в пищевых продуктах и объектах внешней среды. Анализатор Vitek MS заменяет стандартные биохимические методы, обеспечивает получение результата за две минуты без длительной пробоподготовки и использования большого количества дорогостоящих реагентов.

Для оперативного выявления патогенных микроорганизмов в пищевых продуктах и объектах окружающей среды используется бактериологический автоматический иммуноанализатор mini VIDAS, позволяющий в течение 24-48 часов выявлять сальмонеллы и листерии.

Для обнаружения фекально-орального загрязнения и порчи пищевых продуктов и непродовольственного сырья в ОМИ предусмотрено применение автоматического анализатора TEMPO.

Для расширения и укрепления нормативно-методической базы, с целью выявления эпидемиологической связи между штаммами, выделенными у лиц, контактных с инфекционными больными, или штаммами, изолированными из объектов окружающей среды, пищевых продуктов и др. в 2018 году в вирусологической лаборатории введен в эксплуатацию секвенатор Seqstudio Thermo fisher. Прибор предназначен для расшифровки генома микроорганизмов – нуклеотидной последовательности ДНК и РНК, для определения генетических характеристик бактерий, грибов и вирусов. Специалисты лаборатории прошли специальное обучение по работе с данным прибором и программным обеспечением, предназначенным для распознавания генома микроорганизмов.

Для индикации материала на особо опасные инфекции в условиях чрезвычайных ситуаций ОМИ оснащен Микроскопом Axio Lab.A1, предназначенным для изучения мазков нативного материала и выделенных культур в реакции иммунной флюоресценции.

Для усиления лабораторной базы и увеличения количества проводимых исследований в единицу времени ОМИ дополнительно оснащен следующими приборами: для проведения полимеразной цепной реакции – термоциклерами для амплификации Rotor-Gene Q и SimpliAmp; автоматическими иммуноферментными анализаторами INFINITE F50 и LAZURITE, термостатами (инкубатором), центрифугами и т.д.

В связи с введением в эксплуатацию нового корпуса, большинство ручных методов в ОМИ переведены в автоматический режим. В отделе работают автоматизированные средоварочные машины и разливочные модули, позволяющие с высокой скоростью и точностью подготовить большие объемы питательных сред, значительно улучшить качество за счет автоматизированной гомогенизации среды, обеспечить воспроизводимость от партии к партии, снизить риск контаминации.

Применением роботизированной станции выделения нуклеиновых кислот позволило выделение нуклеиновых кислот для полимеразной цепной в оперативно в автоматическом режиме

Благодаря приобретенному оборудованию увеличилась производительность и скорость выполнения исследований проб объектов массовых мероприятий и материала от декретированного контингента на носительство кишечных вирусов и патогенной бактериальной микрофлоры в период подготовки и проведения в г. Казани Чемпионата мира по футболу FIFA 2018 года.

Современная приборная база, наряду с высоким профессионализмом сотрудников, позволила выполнить межлабораторной сравнительные испытания со 100% точностью.

В связи с наличием достаточных площадей, современного парка высокотехнологичного оборудования, на сегодняшний день создаются условия для расширения географии обслуживаемых территорий как субъектов Приволжского Федерального Округа и так других регионов РФ.

Ведутся работы по созданию лабораторной базы референс-центра по ГЛПС (геморрагическая лихорадка с почечным синдромом) и ИСМП (инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи).

Совместно со специалистами ФБУН «Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора проводятся исследования по выявлению природных очагов хантавирусов на территории Приволжского Федерального округа.

Совместно со специалистами Управления Роспотребнадзора по Республике Татарстан разработана программа производственного контроля для медицинских организаций. Разработано информационно-методическое письмо по микробиологическому мониторингу внутрибольничной среды и пересмотрены действующие методические указания МУК 4.2.2942-11 «Методы санитарно-бактериологических исследований объектов окружающей среды, воздуха и контроля стерильности в лечебных организациях».

По результатам деятельности за последние несколько лет сотрудниками ОМИ опубликовано более 42 публикаций, в т.ч. 18 в журналах, рецензируемых ВАК, получен 1 патент на изобретение и выпущено 1 учебно-методическое пособие.
На базе новых помещений лабораторного корпуса создан научно-практический центр медико-профилактического факультета Казанского государственного медицинского университета, Казанского фармацевтического колледжа.